L'Ente Nazionale Protezione Animali nasce a Torino nel 1871 con il nome di Società Protettrice degli animali per iniziativa di Giuseppe Garibaldi e da allora si batte per la tutela dei diritti di tutti gli animali, senza distinzione di razza o specie. 
Dopo varie modifiche di ordinamento, con il D.P.R. 31.03.1979 viene privatizzato perdendo la personalità di diritto pubblico ma conservando la qualifica di Ente Morale e il proprio Corpo delle Guardie Zoofile. Da questa data quindi l'Ente non riceve contributi dallo Stato. Dal 2004 l'E.N.P.A. e' una ONLUS, Organizzazione Non Lucrativa di Utilità Sociale, ai sensi del Decreto Legislativo 460/97.

L'E.N.P.A. si sviluppa in modo omogeneo su tutto il territorio nazionale con 150 sedi, 60 strutture di ricovero per animali randagi o selvatici e una media di 2000 volontari.

Tutte le cariche, comprese quelle direttive, sono esclusivamente volontarie.